El Centro de Ecología Aplicada ha desarrollado desde el 2005 el plan de Manejo en la Laguna Conchalí desde el 2005, encomendado por Minera Los Pelambres (MLP).

La Laguna Conchalí se encuentra en terrenos de propiedad de la Minera Los Pelambres (MLP), compañía que en el año 1997 se comprometió a su protección y restauración en el largo plazo, logrando en el 2000, su designación como Santuario de la Naturaleza, y en el 2004 este ecosistema fue declarado Sitio Ramsar. Uno de los compromisos que derivan de la Convención Ramsar es el de desarrollar un plan de manejo, como instrumento de gestión para su conservación, el cual fue encargado al Centro de Ecología Aplicada.

La Laguna Conchalí es un humedal costero ubicado 4 km al norte del poblado de Los Vilos, en la comuna del mismo nombre, Provincia del Choapa, Región de Coquimbo. Inmediatamente al sur del humedal se encuentran las instalaciones del Puerto Punta Chungo, operado por Minera Los Pelambres, donde se localizan las instalaciones de filtrado y acopio de concentrado de cobre, el que es posteriormente cargado a granel en las bodegas de los buques que regularmente atracan en el muelle de Punta Chungo.

El objetivo del servicio corresponde a realizar una caracterización ecosistémica integrada y el diagnóstico del humedal, en el que se propone un programa de monitoreo, especificando los parámetros a monitorear, su frecuencia de muestreo, las metodologías y técnicas de medición. Entre las variables monitoreadas se encuentran la hidrología (mediante estaciones autónomas con sensor de nivel de registro continuo y sensores de nivel de registro continuo), batimetría, espejo de agua, la dinámica temporal de dunas y barra como condición de borde, calidad de agua, cobertura vegetal, riqueza de especies, especies exóticas, limnología y avifauna.

El trabajo de monitoreo ha contribuido al seguimiento de la condición ecológica de la laguna y permite evaluar potenciales eventos que pudieran afectar el proceso natural de envejecimiento del humedal.